تیمی از دانشمندان که در تلاشند یک زیردریایی هسته‌ای روسی را از بستر دریا در سواحل میامی فلوریدا بالا بکشند، یک اثر باستانی آتلانتیسی را از کف دریا کشف می‌کنند و یک کارشناس را برای تحلیل آن دعوت می‌کنند. اما در حین تلاش برای بالا کشیدن زیردریایی، نشت رادیواکتیو از موشک‌های آن باعث ظهور دوباره آتلانتیس می‌شود و موج‌های ناشی از آن، سکوی تحقیقاتی را ویران کرده و تنها گروه کوچکی از بازماندگان را باقی می‌گذارد. آنها توسط دو کهنه‌سرباز ویتنامی که در حال استراحت بعد از آخرین کارشان هستند نجات می‌یابند، اما قایق آنها در یک جزیره کارائیبی نزدیک به گل می‌نشیند. در حالی که به ساحل می‌روند، متوجه می‌شوند که همه چیز ویران شده و همه کشته شده‌اند. عاملان این فاجعه، گروهی وحشی و مسلح به نام دزدان و رهبرشان، کریستال اسکال، از نسل نژاد اصلی آتلانتیس هستند که در تلاشند تا دنیا را دوباره تصاحب کنند و بازماندگان را به لیست قربانیان اضافه کنند در حالی که برای بقا و شکست دزدان می‌جنگند و آتلانتیس را به بستر دریا بازمی‌گردانند.